MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 7715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015564	GAC	2	6	359526	359531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015564	TCC	2	6	361747	361752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_015564	CG	3	6	361782	361787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_015564	GTA	2	6	361831	361836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015564	TGG	2	6	362693	362698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015564	GAT	2	6	362795	362800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015564	CCATC	2	10	362825	362834	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
508	NC_015564	CGC	2	6	363271	363276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_015564	GGC	2	6	365742	365747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015564	GAT	2	6	367716	367721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015564	CAT	2	6	367746	367751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_015564	TAC	2	6	368007	368012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_015564	CGT	2	6	368017	368022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_015564	CGG	2	6	368034	368039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_015564	TCCC	2	8	374151	374158	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
516	NC_015564	CAC	3	9	375479	375487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_015564	ACT	2	6	375534	375539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_015564	CCT	2	6	375779	375784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_015564	CTA	2	6	375785	375790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015564	AGG	2	6	375822	375827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_015564	GTG	2	6	375829	375834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015564	ACGCCT	2	12	381361	381372	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
523	NC_015564	ACA	2	6	382613	382618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_015564	CAG	2	6	382683	382688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_015564	CGCC	2	8	387671	387678	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
526	NC_015564	TAG	2	6	387715	387720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_015564	AC	3	6	388785	388790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_015564	CCG	2	6	388821	388826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_015564	AGG	2	6	388830	388835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015564	GC	3	6	393894	393899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_015564	GCGG	2	8	394300	394307	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
532	NC_015564	GGCA	2	8	396312	396319	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
533	NC_015564	CG	3	6	397542	397547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_015564	CTTA	2	8	398298	398305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
535	NC_015564	GTG	2	6	398354	398359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015564	ACA	2	6	398431	398436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_015564	ACC	2	6	399617	399622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_015564	GGT	2	6	399640	399645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015564	AGC	2	6	399663	399668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015564	GCAG	2	8	399690	399697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
541	NC_015564	CTCCG	2	10	401130	401139	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
542	NC_015564	GTT	2	6	401427	401432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015564	CTG	2	6	401467	401472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015564	GCG	2	6	401495	401500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_015564	TG	3	6	401501	401506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015564	AAGA	2	8	401724	401731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_015564	GGT	2	6	401996	402001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
548	NC_015564	TGA	2	6	402914	402919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015564	TCGA	2	8	404116	404123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_015564	GCG	2	6	404156	404161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_015564	GC	3	6	404199	404204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_015564	CTA	2	6	404251	404256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_015564	AGC	2	6	404305	404310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_015564	CTG	2	6	404353	404358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015564	GTG	2	6	404806	404811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015564	AG	3	6	404866	404871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015564	AGT	2	6	404878	404883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015564	CACATC	2	12	405628	405639	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_015564	GGC	2	6	405667	405672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015564	GCC	2	6	405694	405699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_015564	GC	3	6	406185	406190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
562	NC_015564	CAC	2	6	406256	406261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_015564	TGG	2	6	407082	407087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015564	GGATT	2	10	407116	407125	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015564	CCT	2	6	409608	409613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015564	GCC	2	6	409684	409689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_015564	GC	3	6	409691	409696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_015564	TC	3	6	409703	409708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_015564	GTCTG	2	10	409717	409726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
570	NC_015564	CGG	2	6	409828	409833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015564	AGG	2	6	409841	409846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015564	GT	3	6	409858	409863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015564	CA	3	6	409879	409884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_015564	TGAG	2	8	409992	409999	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015564	GAG	2	6	410002	410007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015564	TTC	2	6	410573	410578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_015564	GTCAT	2	10	410605	410614	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
578	NC_015564	AAC	2	6	410629	410634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015564	AAGG	2	8	410637	410644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015564	GC	3	6	411257	411262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
581	NC_015564	CCG	2	6	411320	411325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_015564	CAA	2	6	411443	411448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_015564	CGTTA	2	10	411458	411467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
584	NC_015564	AAG	2	6	411487	411492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015564	TCG	2	6	416731	416736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_015564	GCC	2	6	416754	416759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_015564	GTT	2	6	416805	416810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015564	GTCGA	2	10	416872	416881	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
589	NC_015564	CTA	2	6	416993	416998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015564	GC	3	6	417055	417060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
591	NC_015564	CGA	2	6	417079	417084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_015564	CGC	2	6	417094	417099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_015564	ACG	2	6	417102	417107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_015564	CGA	2	6	417118	417123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_015564	CGC	3	9	417235	417243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_015564	ATC	2	6	417245	417250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_015564	AC	3	6	417327	417332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_015564	GCT	2	6	417445	417450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_015564	TGG	2	6	417483	417488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015564	ACA	2	6	417639	417644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_015564	TGCT	2	8	417650	417657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_015564	CCAT	2	8	421870	421877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_015564	TGG	2	6	421960	421965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015564	ACG	2	6	429408	429413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_015564	CG	3	6	431890	431895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_015564	GCT	2	6	431951	431956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_015564	TCTG	2	8	431982	431989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_015564	TCT	2	6	432002	432007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_015564	GAG	2	6	433546	433551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015564	AGG	2	6	433602	433607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015564	GC	3	6	433651	433656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
612	NC_015564	GGCG	2	8	433658	433665	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
613	NC_015564	CTG	2	6	433678	433683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_015564	TTG	2	6	433727	433732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015564	GCTG	2	8	433741	433748	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_015564	CCT	2	6	433749	433754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_015564	GTT	2	6	433766	433771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015564	GTTC	2	8	433809	433816	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_015564	CCA	2	6	433823	433828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_015564	GAC	2	6	433854	433859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015564	GCG	2	6	433884	433889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_015564	CG	3	6	433888	433893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_015564	TTCG	2	8	434035	434042	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
624	NC_015564	GCC	2	6	437393	437398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_015564	TTA	2	6	437421	437426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015564	GAA	2	6	437430	437435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015564	CAA	2	6	441485	441490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_015564	GCCC	2	8	441492	441499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
629	NC_015564	GGGC	2	8	441510	441517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
630	NC_015564	GAA	2	6	442492	442497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015564	GT	3	6	443824	443829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015564	TCCG	2	8	444794	444801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_015564	CGC	2	6	444802	444807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
634	NC_015564	CCTG	2	8	447910	447917	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
635	NC_015564	TTCC	2	8	447974	447981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_015564	AAGC	2	8	448014	448021	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_015564	ACC	2	6	448935	448940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_015564	AAGG	2	8	458099	458106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_015564	TGG	2	6	621187	621192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
917	NC_015564	TGG	2	6	621197	621202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
918	NC_015564	TG	3	6	621203	621208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
919	NC_015564	GTG	2	6	621227	621232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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923	NC_015564	CCG	2	6	621421	621426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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929	NC_015564	CCG	2	6	621612	621617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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948	NC_015564	ACC	2	6	622840	622845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
949	NC_015564	CGG	2	6	622867	622872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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952	NC_015564	TGC	2	6	623057	623062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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